高等真菌与低等真菌的主要不同在于细胞结构和生活习性。低等真菌是无核真菌，其细胞结构简单，生活习性营养单一，而高等真菌是有核真菌，其细胞结构复杂，生活习性多样，可以从多种营养物质中获得营养。
高等真菌与低等真菌有什么区别
1、低等真菌
大多成长在水中或土壤中，主要病害有猝倒病、根腐病、霜霉病、白锈病、疫病、绵疫病等。一般在低温（15—20摄氏度）潮湿的春秋两季发病较多。
2、高等真菌
主要病害有赤霉病、白粉病、炭疽病、叶斑病、黑斑病等。如：麦类赤霉病；花生黑斑病；葡萄、苹果、桃、瓜类、麦类、豆类、甜菜白粉病；棉花、豆类、瓜类炭疽病；苹果、梨黑星病；桃、杏缩叶病；瓜类蔓枯病；葡萄黑腐病、房枯病；苹果轮纹病、黑腐病、腐烂病、干腐病；葱叶枯病；茄子褐纹病等。病害以点发生为多，受害部位有较明显的边缘，而形成肯定形状的病斑。
什么是真菌
真菌，是一种具真核的、产孢的、无叶绿体的真核生物。包括霉菌、酵母、蕈菌与别的人类所熟悉的菌菇类。已经发现了十二万多种真菌。真菌独立于动物、植物和其他真核生物，自成一界。真菌的细胞有含甲壳素，能通过无性繁殖和有性繁殖的方法产生孢子。
真菌和细菌有什么不同
1、风险不同
真菌分为有益真菌和有害真菌。绝大部分对人有益，如酿造工业和生产抗生素、维生素、酶制剂等。但少数真菌对人有致病性。如皮肤廯菌、白色念珠菌等。
细菌既可能有害也会有益，取决于细菌类型，有益的如肠道细菌和益生菌，有害细菌感染包含霍乱，肺结核，莱姆病，沙门氏菌，葡萄球菌感染，链球菌性喉炎，麻风，破伤风。
2、名字组成不同
尽管在细菌和真菌的名字中都有一个菌字，但细菌的名字中一般含有：球、杆、弧、螺旋等描述细菌形态的字眼，只有乳酸菌例外（实为乳酸杆菌）；而真菌名字中则不含有。
3、细胞大小不同
原核细胞一般较小，直径一般为1μm——10μm；真核细胞较大，直径一般为10μm——100μm。
4、增殖方法不同
细菌是原核生物，为单细胞型生物，通过细胞分裂而增殖，具备原核生物增殖的特有方法——二分裂；真菌为真核生物，细胞的增殖主要通过有丝分裂进行，因真菌类型的不同其个体增殖方法主要有出芽生殖（如酵母菌）和孢子生殖（食用菌）等方法。
5、细胞结构不同
细菌和真菌都具备细胞结构，是细胞型生物，在它们的细胞结构中都具备细胞壁、细胞膜、细胞质，但却存在很多不同，具体表目前：
a、是细胞壁的成分不同：细菌细胞壁的主要成分是肽聚糖，而真菌细胞壁的主要成分是几丁质。
b、是细胞质中的细胞器组成不同：细菌只有核糖体一种细胞器；而真菌除具备核糖体外，还有内质网、高尔基体、线粒体、中心体等多种细胞器。
c、是细菌没成形的细胞核，只有拟核；真菌具备。
d、是细菌没染色体，其DNA分子单独存在；真菌细胞核中的DNA与蛋白质结合在一块形成染色体（染色质）。
